Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN3Q9Y4C0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms