Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COQ4Q9Y3A0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ4Q9Y3A0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms