Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL20Q9Y2M5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms