Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFR3BQ9Y2G0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFR3BQ9Y2G0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms