Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms