Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDZRN3Q9UPQ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms