Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO6Q9UM54 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO6Q9UM54 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms