Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NWD2Q9ULI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms