Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP21Q9UK80 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP21Q9UK80 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP21Q9UK80 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP21Q9UK80 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms