Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms