Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC24A2Q9UI40 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A2Q9UI40 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms