Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF4Q9UHB7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms