Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms