Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms