Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHA6Q9UF33 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA6Q9UF33 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms