Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms