Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLHL42Q9P2K6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms