Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms