Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMG20BQ9P0W2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms