Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2L1Q9P0L9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms