Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms