Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD2Q9NZN4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD2Q9NZN4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms