Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MYOFQ9NZM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms