Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RDH8Q9NYR8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RDH8Q9NYR8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RDH8Q9NYR8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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