Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMOD3Q9NYL9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms