Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL28Q9NXS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms