Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms