Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EMILIN3Q9NT22 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMILIN3Q9NT22 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMILIN3Q9NT22 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMILIN3Q9NT22 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms