Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM7SF3Q9NS93 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms