Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPHK2Q9NRA0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms