Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPRD1BQ9NQG5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPRD1BQ9NQG5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms