Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FZD3Q9NPG1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms