Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NGRNQ9NPE2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGRNQ9NPE2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms