Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTA1Q9NP79 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VTA1Q9NP79 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms