Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SSU72Q9NP77 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms