Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBEC3GQ9HC16 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms