Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms