Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms