Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms