Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOBPQ9H2D6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms