Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y3

OPN3, Opsin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3Q9H1Y3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPN3Q9H1Y3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms