Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms