Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF3Q9H094 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBPF3Q9H094 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NBPF3Q9H094 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBPF3Q9H094 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.6 ms