Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms