Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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