Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
REXO4Q9GZR2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms