Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACTR3CQ9C0K3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms