Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A8Q9C0K1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms