Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA4CQ9C0C4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms