Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NMES1Q9C002 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms